SFB1551 Projekt: R13

Titel des Projekts: Computergestützte Untersuchung der Evolution und des Sequenzkontexts von Arginin/Glycin-reichen Sequenzen

Zusammenfassung: Arginin-/Glycin-reiche (RG-rich) Sequenzen in Proteinen sind zu einem interessanten Forschungsgebiet geworden, da sie in vielen Proteomen häufig vorkommen und unterschiedliche Funktionen haben, wie z. B. ihre treibende Rolle bei der Phasentrennung, der Bildung von membranlosen Organellen (MLOs) oder ihre Rolle bei der Transkription, der Signalisierung von DNA-Schäden, dem Spleißen von prä-mRNA, der mRNA-Translation und anderen DNA/RNA-Verarbeitungsfunktionen. Ihre Evolution und ihr komplexer Sequenzkontext sind nicht verstanden. Mit einer groß angelegten, systematischen, computergestützten Studie möchte ich die Definition von RG-reichen Sequenzen verfeinern, Untergruppen von RG-reichen Motiven finden und Evolution und Kontext verstehen, um die RG-Funktionalität manipulieren und vorhersagen zu können.