Gemeinsame Veranstaltung des SFB 1551 und der Seminarreihe TRR 146 - Abhishek Singharoy

Gesprächsankündigung von Abhishek Singharoy

*Biophysik an der Schwelle zum Exascale-Computer - Das Zeitalter der molekularen Simulationsroboter*

Zusammenfassung:
Die molekulare Modellierung biomolekularer Baugruppen ist ein Beispiel für einen Bereich, der sowohl vielversprechend als auch umstritten ist. Wir beginnen mit einer kurzen Geschichte über die Simulation der allerersten Zellorganelle in molekularen Details, um herauszufinden, wie die Natur als evolutionäres Design die Überlebensfähigkeit über die Effizienz der Energieübertragung gestellt hat. Trotz solcher Fortschritte im Exascale-Computing hat die biophysikalische Simulation nach wie vor mit der Handhabung der molekularen Vielfalt zu kämpfen. Daher werden wir Deep-Learning-Ansätze einsetzen, die häufig bei Google-Suchen verwendet werden, das so genannte Inception Network, um Interaktionssignaturen aus Alphafold-Modellen und Proteomanalysen mit vorhersagbaren Patientenergebnissen zu verbinden. Anhand einer Anwendung wird gezeigt, wie die molekulare Modellierung in industriellem Maßstab eingesetzt wird, um das Risiko von vektorbasierten Impfstoffen für den Vertrieb in 194 Ländern zu senken. Abschließend werden wir sehen, dass vorübergehende Wechselwirkungen schwer vorherzusagen sind und Pfadintegrale mit Verstärkungslernen eine Möglichkeit bieten, die Vielfalt der Dynamik zu verfolgen. 

von Assistenzprofessor Abhishek Singharoy

Arizona State Universität

Schule für Molekularwissenschaften